训练家可以治愈他们的神奇宝贝，甚至可以在看似免费的神奇宝贝中心过夜，但他们必须从某个地方赚到钱。
任何东西都要花钱，即使在神奇宝贝的世界里也是如此。屏幕上从未显示过金钱被交换，但不断谈论东西的成本和必须支付的费用。然而，出于某种原因，神奇宝贝中心似乎从未出现在这些对话中。
神奇宝贝中心对训练家来说是免费的。这反映了游戏如何不向训练家收取治疗他们的神奇宝贝的费用，但这仍然没有解释这是怎么可能的。在动漫中，训练师甚至会像在住宿加早餐旅馆一样吃饭和过夜；也没有人谈论为此付出代价。在没有任何解释的情况下，粉丝们只能猜测神奇宝贝中心从哪里获得资金。
一些理论认为神奇宝贝中心是由当地的神奇宝贝集市资助的。培训师将购买他们需要的所有用品以及更多用品，以确保他们做好上路旅行的准备。这些钱的一部分可能会被送到神奇宝贝中心，这样他们就可以维持业务的运转。当两个机构合并为一栋建筑时，这一理论从第五代开始获得了信任。
神奇宝贝中心也可能得到神奇宝贝联盟等活动的支持。各种与神奇宝贝相关的活动都需要训练家保持他们的神奇宝贝处于最佳状态；道馆之战、联赛之战、竞赛、展示柜和岛屿挑战。然后是所有当地的动漫专属 比赛，如 pokéringer、whirl cup、pokémon ping pong 锦标赛、club battle、world tournament junior cup 和各种比赛。所有这些活动都需要训练师访问神奇宝贝中心，并确保他们的神奇宝贝为即将到来的事情做好准备。如果所有这些活动只捐出他们赚到的一点钱给当地的神奇宝贝中心，那将很容易弥补他们所有的免费治疗。
神奇宝贝中心也可以像任何医疗保健系统一样获得资金。除捐款外，资金还可以来自县或市的一般税收、社会医疗保险、自愿或私人医疗保险，或自付费用。如果是一般征税的话，游戏和动画就完全不需要解释了。自从神奇宝贝世界在很大程度上反映了日本文化，神奇宝贝中心可能会像日本一样依赖社会医疗保险。或者，所有训练家都可以拥有私人健康保险计划，允许他们在需要时使用神奇宝贝中心；这种责任也可以解释为什么首先要有最低年龄要求才能成为培训师，即使这个年龄有点小。对于神奇宝贝中心运营的规模，自付费用是极不可能的。众所周知，除了直接从训练家那里拿钱之外，神奇宝贝中心还可以通过多种收入来源保持运转。
然而，神奇宝贝中心仍在营业，训练家可能会对这项服务表示感谢。去这些避风港之一让他们和他们的神奇宝贝休息的舒适感似乎是无与伦比的。他们可能确实需要以某种形式为此付出代价，但当他们走进大门时，这并不是他们必须为之烦恼的事情
